TMT（Tandem Mass Tag™）标记蛋白质组学
产品简介
TMT（Tandem Mass Tag™）标记蛋白质组学是一种基于体外同位素标记的定量蛋白质组学技术，由ThermoFisher Scientific公司研发。TMT采用一系列重量不同的化学标签，这些标签能够特异性地结合到肽段的氨基基团上。通过这种方法，可以同时处理多个样本，并将样本混合在一起进行质谱分析。TMT技术允许多达16个不同的样品同时进行定量分析，因此是蛋白质组学研究中的一个强大工具。
技术优势
1.技术成熟，应用广泛。
2.同时检测多个样品，实验、数据分析难度低。
3.适用于绝大多数类型组织、细胞、体液。
TMT适用条件
1.样本类型：除粪便、肠道内容物等杂质极高的样本外，基本都适用。
2.客户样本数量少于16个并且想尽可能多的鉴定出蛋白，优先选择TMT。
3.客户样本数量大于16个不建议TMT，优先选择DIA。
4.磷酸化修饰可以选用TMT，其他类型的翻译后修饰不建议。
仪器平台
Thermo Scientific Orbitrap Astral
服务流程
分析内容
标准分析内容 | |
质控评价 | 肽段离子质量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白质丰度比分布 |
蛋白质鉴定分析 | 鉴定与定量结果统计；单个样本蛋白质鉴定结果统计；韦恩图 |
差异蛋白分析 | 差异蛋白统计；火山图；聚类热图 |
功能分析 | 亚细胞定位；GO富集分析；KEGG/Reactome通路分析；互作网络分析； |
个性化分析 | 与客户协商后按实际情况执行 |
送样建议
样本类型 | 推荐起始量 | 建议样品处理流程 |
细胞 | >1×107
| 贴壁细胞 1.倾掉培养基，用PBS清洗3次，加入胰酶； 2.消化好的细胞转入EP管，室温3000 g离心5 min，弃掉上清； 3.PBS清洗3次，上清吸净，细胞沉淀立即-80℃冰箱储存。 或者 1.倾掉培养基，用PBS清洗3次后加入裂解液； 2.细胞刮刮细胞培养板，收集细胞裂解液，立即-80℃冰箱储存。
悬浮细胞 1. 3000×g离心5min收集细胞沉淀； 2.PBS清洗3次，立即-80℃冰箱储存。 |
动物组织 | >30mg | 1.取目标部位组织，迅速取材且大小均一，将组织切成0.5cm左右的小块； 2.组织小块浸入PBS，洗掉组织中残留的血； 3.用无尘纸吸净表面的液体，立即-80℃冰箱储存。 |
植物组织 | >100mg | 1.选取干净的目标部位组织，迅速取材且保证取材均一；将组织剪成0.5cm左右的小块； 2.组织立即-80℃冰箱储存。 |
微生物 | >50mg | 1.收集菌体培养物，3000g离心5min，弃掉培养基； 2.PBS清洗3次，保留细菌沉淀，-80℃冰箱储存。 |
血清/血浆 | >100μL | 血清 取普通采血管收集血液，室温静置，上层洗出的液体即为血清。 血浆 取抗凝采血管收集血液，使血液与管壁充分接触，1000×g 4℃离心10-15min,上层即为血浆。 |
结果展示
案例分析
西湖大学生命科学学院郭天南课题组与合作团队在Cell在线发表了题为：Multi-organ Proteomic Landscape of COVID-19 Autopsies的研究论文，绘制了2020年初因新冠肺炎去世的患者体内多器官组织样本中蛋白质分子病理全景图。该团队收集了19例新冠去世患者的肺、脾、肝、心脏、肾脏、甲状腺和睾丸等七种器官的组织样本，基于TMT标记蛋白质组学鉴定了11394个人源蛋白质分子，这是在全球范围内初次从蛋白质分子水平上，对新冠患者多个关键器官针对新冠病毒感染做出的响应进行了详细和系统的分析，为临床工作者和研究人员制定治疗方案、开发新的药物及治疗方法提供了线索和依据。
