真核有参转录组
产品简介
转录组（Transcriptome）是一个生物体内所有基因在特定时期和特定组织或细胞类型中表达出的所有信使RNA（mRNA）的集合，即转录组是一个生物体内所有基因的转录产物总和。它反映了细胞在某一生理条件下所有基因表达的整体情况，是基因功能及结构研究的基础和出发点。
技术优势
1.价格公道合理。
2.样品处理经验丰富。
3.分析内容丰富，一站式科研解决平台。
仪器平台
Illumina/T7灵活可选
服务流程
分析内容
生信分析条款 | 分析内容 |
标准信息分析 | 1.测序数据过滤 2.参考基因组比对 3.新转录本预测 4. SNP和INDEL检测 5.差异剪接基因检测 6. 基因表达量计算（基因比对率及表达数目统计、Reads 对转录本的覆盖度及分布、样品间的相关性、PCA 分析、样品中基因表达量的分布、样品间及组间的基因表达情况） 7 差异表达基因检测 8. 差异表达基因维恩图分析 9. 差异表达基因层次聚类分析 10. 差异表达基因GO功能分析 11. 差异表达基因Pathway功能分析 12. 差异表达基因转录因子预测 13. 差异表达基因蛋白互作分析 |
高级信息分析 | 与客户协商后，按照实际情况执行 |
送样建议
样本类型 | 推荐起始量 | 保存/运输方式 |
细胞 | >5×106 | 液氮速冻，-80℃保存，干冰运输 |
动物组织 | >50mg | 液氮速冻，-80℃保存，干冰运输 |
植物组织 | >100mg | 液氮速冻，-80℃保存，干冰运输 |
结果展示
案例分析
中科院昆明动物所基于基因组学和感染转录组学研究了北平顶猴I型艾滋病病毒（HIV-1）持续性感染的免疫调控机制，为构建合适的HIV-1非人灵长类动物模型提供了科学数据。相关研究论文“Genomic evidence for the nonpathogenic state in HIV-1-infected northern pig-tailed macaques”在线发表在国际知名学术期刊Molecular Biology and Evolution。
缺乏直接感染I型艾滋病病毒（HIV-1）的动物模型是制约艾滋病研究的关键瓶颈之一。为构建可直接感染HIV-1并发展为艾滋病的合适非人灵长类动物模型，研究者通过转录组学研究了北平顶猴HIV-1持续性感染的免疫调控机制。对HIV-1感染北平顶猴后连续时间点的外周血单核细胞进行了转录组测序，筛选与HIV-1复制水平低下相关的候选基因。发现在HIV-1感染北平顶猴后上调的基因中，有一部分干扰素诱导基因（ISG）在感染1-2周迅速上调，其中IFI27基因上调显著。北平顶猴的IFI27基因与人的同源基因相比发生大量突变。在体外过表达和敲低实验中，均发现北平顶猴IFI27可能是北平顶猴特异的HIV-1限制因子，可特异地抑制HIV-1复制，这可能也是HIV-1在北平顶猴中低水平复制的机制之一。
