扩增子测序（18S/ITS/16S）
产品简介（以16S为例）
16S高通量测序主要用于研究环境或粪便等样本中细菌群落的结构和多样性。由于16S rRNA在不同种类的细菌中具有高度保守性和变异性，因此被广泛用作细菌分类和鉴定的分子标记。
在16S高通量测序过程中，首先通过PCR技术扩增样品中的16S rRNA基因特定区域（如V3-V4区、V4区或V4-V5区等），然后对扩增产物进行高通量测序，这些序列数据可以与已知的16S rRNA基因序列库进行比对，从而识别并分类样品中存在的微生物。通过对不同样品中微生物群落结构的比较，可以揭示微生物群落的多样性和分布规律，为环境科学研究、医学诊断、生物技术应用等领域提供重要信息。
技术优势
1.价格公道合理。
2.样品处理经验丰富。
3.分析内容丰富，一站式科研解决平台。
仪器平台
Illumina Miseq/Novaseq
服务流程
分析内容
| 生信分析条款 | 分析内容 |
数据处理 | 数据过滤 Reads拼接 |
OUT及其丰度分析 | OTU统计 OTU venn图分析 Core-Pan OTU分析 OTU PCA分析 物种累计曲线分析 OTU PLS-DA分析 OTU Rank曲线 |
物种及其丰度分析 | 物种注释 物种丰度热图 物种系统发育进化分析 |
样品多样性分析 | 单个样品多样性分析（Alpha 多样性） 样品间多样性比较分析（Beta 多样性） 样品间物种组成聚类分析 |
组间差异分析 | LEfSe 分析 T检验 Wilcox Test Kruskal Test |
功能预测（PICRUSt） | 功能预测 功能差异分析（T检验、Wilcox Test） |
高级信息分析 | 与客户协商后，按照实际情况执行 |
送样建议
| 粪便 | ＞100mg | 液氮速冻，-80℃保存，干冰运输 |
土壤 | ＞200mg | 液氮速冻，-80℃保存，干冰运输 |
结果展示
案例分析
中国农业科学院兰州兽医研究所王帅课题组在npj Biofilms and Microbiomes杂志在线发表一篇题为：Interaction between tissue-dwelling helminth and the gut microbiota drives mucosal immunoregulation的论文，通过16S高通量测序等方法，发现多房棘球蚴可以通过调节肠道菌群治疗肠道炎症，揭示了重要的肠道炎症治疗机理。
研究人员采用肠外寄生的多房棘球蚴模型，探讨了宿主-蠕虫-细菌在调节宿主结肠Treg中的互作关系机制。研究发现，腹腔感染多房棘球棘可减轻Balb/c小鼠的结肠炎，并诱导结肠Foxp3+Treg细胞群显著扩增。通过16S高通量测序等技术发现，棘球蚴感染后宿主肠道微生物群结构和代谢能力发生了显著变化，这些变化的微生物促进了Treg的增加。该研究初次证明肠外寄生的蠕虫可以通过宿主肠道微生物中的益生菌驱动宿主结肠Treg的扩张，揭示出了复杂的互作机理，为肠道炎症的治疗提供重要的参考。另外，本研究也揭示了重要人兽共患寄生虫病-棘球蚴病对宿主的免疫调节机制，为棘球蚴病的新型防治技术开发提供方向。
